Integration of information is quintessential to make use of the wealth of bioinformatics resources. One aspect of integration is to make databases interoperable through well annotated information.... Show moreIntegration of information is quintessential to make use of the wealth of bioinformatics resources. One aspect of integration is to make databases interoperable through well annotated information. With new databases one strives to store complementary information and such results in collections of heterogeneous information systems. Concepts in these databases need to be connected and ontologies typically provide a common terminology to share information among different resources.Our focus of research is the zebrafish and we have developed several information systems in which ontologies are crucial. Pivot is an ontology describing the developmental anatomy, referred to as the Developmental Anatomy Ontolgoy of Zebrafish (DAOZ). The anatomical and temporal concepts are provided by the Zebrafish Information Network (ZFIN) and proven within the research community. We have constructed a 3D digital atlas of zebrafish development based on histology; the atlas is series of volumetric models; in each instance, every volume element is assigned to an anatomical term. Complementing the atlas we developed an information system with 3D patterns of gene expression in zebrafish development based on marker genes. The spatial and temporal annotations to these 3D images are drawn from the ontology that we have designed. In its design the DAOZ ontology is structured as a Directed Acyclic Graph (DAG). Such is required to find unique concept paths and prevent self referencing.As we need to address the ontology in a direct manner, the DAG structure is transferred to a database. The database is used in the integration of our databases that share concepts at different levels of aggregation. In order to make sure that sufficient levels of aggregation for applications in mind are present, the original vocabulary was enriched with more relations and concepts. Both databases can now be addressed with the same unique terms and co-occurrence and co-expression of genes can be readily extracted from the databases. Integration can be further extended to the ZFIN resource and also by including ontologies that relate to gene/gene expression (e.g. Gene Ontology). In this manner, interoperable information retrieval from heterogeneous databases can be realized. This greatly facilitates processing complex information and retrieving relations in the data through machine learning approaches. Show less
Naast het geven van onderwijs en het doen van onderzoek, worden er ook andere interessante activiteiten ontplooid op het Leidse Departement Bestuurskunde. Zo vond op 7 juni jl. op de Campus Den... Show moreNaast het geven van onderwijs en het doen van onderzoek, worden er ook andere interessante activiteiten ontplooid op het Leidse Departement Bestuurskunde. Zo vond op 7 juni jl. op de Campus Den Haag een bijzondere bijeenkomst plaats, georganiseerd door het Departement in samenwerking met de Raad voor het Openbaar Bestuur. Aanleiding voor dit symposium was het eerder verschenen advies 'Normalisatie rechtspositie overheidspersoneel' van de Raad voor het Overheidspersoneel. In dit rapport werd gesproken over de verschillen tussen het werken voor de overheid en het bedrijfsleven, welke vooral te vinden zijn op het gebied van het imago, beloning, doelstelling, aard, karakter en de grootte van de bedrijvigheid. Onder leiding van dagvoorzitter Frank Kerckhaert (burgemeester van Hengelo) werd er samen met de meer dan 80 aanwezigen, waaronder enkele speciale gasten, zoals voormalig minister Klaas de Vries en rectormagnificus Paul van der Heijden, druk gebrainstormd tijdens workshops van de Leidse bestuurskundigen prof. dr. Mark Rutgers, mr. dr. Gerrit Dijkstra, prof. dr. Theo Toonen en dr. Frits van der Meer. Show less
Heb jij altijd al onderzoek willen doen naar fenomenen die niet in Nederland voorkomen, colleges willen volgen van inspirerende professoren waar je alleen in boeken over hebt kunnen lezen, willen... Show moreHeb jij altijd al onderzoek willen doen naar fenomenen die niet in Nederland voorkomen, colleges willen volgen van inspirerende professoren waar je alleen in boeken over hebt kunnen lezen, willen leren van andere academische inzichten en nieuwe culturen willen proeven? Voor de echte nieuwsgierige student gelden geen grenzen meer. Nieuwe regelingen maken het mogelijk om met behoud van studiefinanciering een volledige studie in het buitenland te volgen. Maar dan begint het avontuur. Welke universiteit moet je überhaupt uitkiezen en hoe kom je daar binnen? Hoe is het onderwijs? Hoe werkt het traject van inschrijven? Hoe regel je je onderkomen? Allemaal vragen waar de Leidse bestuurskunde-alumnus Jeroen Broekema mee worstelde, maar aan niemand kon stellen, toen hij zelf een masteropleiding in het buitenland wilde volgen. Hij was zodoende een jaar geleden één van de oprichters van NEWS: Nederlandse Wereldwijde Studenten. Dit netwerk van Nederlandse expats aan buitenlandse universiteiten biedt alle informatie en is een platform om ervaringen uit te wisselen. Show less
Het was even onduidelijk of de jaarlijkse Heinekenexcursie dit jaar wel doorgang zou vinden, maar uiteindelijk was het op 8 mei dan toch zo ver. De 8.1.L. reisde met een delegatie enthousiaste... Show moreHet was even onduidelijk of de jaarlijkse Heinekenexcursie dit jaar wel doorgang zou vinden, maar uiteindelijk was het op 8 mei dan toch zo ver. De 8.1.L. reisde met een delegatie enthousiaste eerstejaars af naar het walhalla voor de bierminnende Leidsche student: de Heinekenbrouwerij te Zoeterwoude. Show less
Le regard que les chercheurs ont porté en France sur Ie phénomène administratif a évolué au fil du temps : cette évolution est indissociable des transformations qu'a subies l&apos... Show moreLe regard que les chercheurs ont porté en France sur Ie phénomène administratif a évolué au fil du temps : cette évolution est indissociable des transformations qu'a subies l'administration au cours des dernières décennies ; elle renvoie aussi aux bouleversements qui ont affecté Ie champ des sciences sociales. Show less
Bekende Fransen als Valéry Giscard d 'Estaing, Lionel Jospin, Alain Jupé, Laurent Fabius en Jacques Chirac hebben met elkaar gemeen dat ze zogenaamde 'énarques' zijn, dat wil zeggen... Show moreBekende Fransen als Valéry Giscard d 'Estaing, Lionel Jospin, Alain Jupé, Laurent Fabius en Jacques Chirac hebben met elkaar gemeen dat ze zogenaamde 'énarques' zijn, dat wil zeggen mensen die zijn afgestudeerd aan de ENA, de 'École Nationale d'Administration'. Een énarque ben je voor het hele leven. Het _is een kwaliteitsetiket waarvan je veel plezier kunt hebben: het geeft toegang tot hoge posities in het openbaar bestuur in Frankrijk. Maar deze eerbiedwaardige opleiding staat momenteel ter discussie. Is ze nog wel van deze tijd? Is ze door recente ontwikkelingen in een 'existentiecrisis' terecht gekomen? Show less
