This thesis describes the development and optimization of the first molecular tools to study the enzyme PLA2G4E. After remaining elusive for many years, in 2016, this enzyme was discovered to be... Show moreThis thesis describes the development and optimization of the first molecular tools to study the enzyme PLA2G4E. After remaining elusive for many years, in 2016, this enzyme was discovered to be responsible for the calcium-dependent formation of N-acylphosphatidylethanolamines (NAPEs) in cells. NAPEs are low-abundant lipid species that play roles in membrane stabilization, cell signaling and homeostasis. They are well-known as precursors to the signaling lipids of the N-acylethanolamine (NAE) class, but their own biological functions remain relatively poorly understood. To find inhibitors of PLA2G4E, a focused compound library was screened in a newly developed activity-based protein profiling (ABPP) assay. Hits were identified and optimized by building structure-activity relationships (SARs) through organic synthesis and activity assays. WEN091 was identified as potent inhibitor of PLA2G4E that was able to reduce cellular NAPE levels. Cellular target engagement was confirmed by use of a tailored activity-based probe. Using these molecular tools, the relevance of NAPEs and PLA2G4E in cellular processes and disease may be elucidated. Show less
NNMT wordt beschouwd als een nieuw potentieel farmacologisch doelwit in de behandeling van een verscheidenheid van kankers, stofwisselingsziekten en andere pathologieën. Het toenemend aantal... Show moreNNMT wordt beschouwd als een nieuw potentieel farmacologisch doelwit in de behandeling van een verscheidenheid van kankers, stofwisselingsziekten en andere pathologieën. Het toenemend aantal publicaties waarin de rol van NNMT bij ziekten wordt opgehelderd, heeft op zijn beurt de ontwikkeling van krachtige en selectieve remmers van NNMT gestimuleerd, waarbij in de afgelopen vijf jaar een toenemend aantal verbindingen is onthuld. Hoofdstuk 1 geeft een uitgebreid overzicht van de huidige status van de ontwikkeling van NNMT remmers, relevante in vitro en in vivo studies, en een bespreking van de uitdagingen waar men bij de ontwikkeling van NNMT remmers voor staat. In hoofdstuk 2 werd een gevarieerde bibliotheek van remmers geprepareerd om de verschillende gebieden van de NNMT bindingsplaats te onderzoeken. In hoofdstuk 3 wordt verslag gedaan van een scaffold-hopping strategie om nieuwe en krachtige bisubstraat NNMT remmers te genereren. In hoofdstuk 4 wordt een prodrug strategie beschreven om de polariteit van verbinding 17u te verlagen en de cellulaire activiteit te verbeteren. In hoofdstuk 5 wordt het ontwerp en de synthese beschreven van een bibliotheek van verbindingen die zich richten op de covalente interactie met actieve site cysteïne en serine residuen met behulp van verschillende functionele groepen. Show less
Muller, C.; Staudacher, V.; Krauss, J.; Giera, M.; Bracher, F. 2013
