Fecal microbiota transplantation (FMT) has been reported to decrease the incidence of recurrent urinary tract infections (UTIs), presumably by restoring microbiome diversity and/or uropathogen... Show moreFecal microbiota transplantation (FMT) has been reported to decrease the incidence of recurrent urinary tract infections (UTIs), presumably by restoring microbiome diversity and/or uropathogen competition. We report a 16-year-old female with recurrent UTIs caused by multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae, for which frequent intravenous broad-spectrum antibiotic treatment was necessary. The patient was treated with FMT from a well-screened healthy donor without multidrug-resistant bacteria in the feces. After FMT, she developed several UTIs with an antibiotic-susceptible Escherichia coli that could be treated orally. The uropathogenic E. coli could be cultured from donor feces, and whole genome sequencing confirmed donor-to-recipient transmission. Our observation should stimulate discussion on long-term follow-up of all infections after FMT and donor fecal screening for antibiotic-susceptible Enterobacterales. Show less
De moleculaire karakterisering van antimicrobi_le resistentie mechanismen onderzocht in dit proefschrift toont de heterogeniteit aan van antimicrobi_le resistentiemechanismen in multiresistente... Show moreDe moleculaire karakterisering van antimicrobi_le resistentie mechanismen onderzocht in dit proefschrift toont de heterogeniteit aan van antimicrobi_le resistentiemechanismen in multiresistente Enterobacteriaceae. Naast de belangrijke overdraagbare ESBL-enzymen, CTX-M, SHV, TEM, plasmidaal gecodeerde AmpC _-lactamasen en carbapenemases zouden multiresistente isolaten in elk geval ook onderzocht moeten worden op de aanwezigheid van andere resistentie genen, zoals de plasmidaal-gemedieerde resistentie genen qnr en aac-6__-Ib-cr. Zoals beschreven in hoofdstuk 2, 3, en 4 is gebleken dat chromosomaal gecodeerde resistentie ook een belangrijke rol speelt. Hoewel verschillende technieken als multiplex PCR en sequentieanalyse, qRT-PCR en microarrays zijn gebruikt, is het gebruik hiervan niet toereikend om alle betrokken genen te kunnen onderzoeken. In het huidige tijdperk van multiresistente bacteri_n zijn moleculaire technieken nodig, die het hele genoom kunnen onderzoeken in __n test. De toepassing van next-generation sequencing (NGS) in een klinisch microbiologisch laboratorium zal alle informatie verstrekken: de identificatie van de species, de gevoeligheid voor antibiotica, de virulentie kenmerken en typering en tenslotte ook de hoeveelheid van de aanwezige species. Mogelijk kan NGS uiteindelijk de meeste, zo niet alle huidige fenotypische microbiologische methoden vervangen.Naast het gebruik van snelle en gevoelige detectie van resistentiemechanismen door niet-fenotypische testen, zal actieve realtime monitoring en surveillance belangrijker gaan worden. Show less
