This thesis demonstrates the application of bioinformatics to investigate the mechanisms that are implicated in Huntington’s Disease (HD). HD is an inherited neurodegenerative disorder and although... Show moreThis thesis demonstrates the application of bioinformatics to investigate the mechanisms that are implicated in Huntington’s Disease (HD). HD is an inherited neurodegenerative disorder and although the cause of the disease is known since 1993 we are still lacking a cure or treatment that can effectively treat the symptoms of HD. In order to tackle such a complicated case study, we followed a multidisciplinary approach to exploit the expertise and knowledge of people with diverse scientific background (chapter 2). This blend of disciplines facilitates constant collaboration between bioinformaticians, wet lab technicians, biologists, computer engineers and data scientists. A collaborative eScience model is proposed as a way to combine state-of-the-art computation analysis and laboratory work (chapter 3). At the same time, we explored methods to preserve the results, materials and methods involved in the experiment to increase the reproducibility and reusability of our research (chapter 4). In chapter 5 we identified disease signatures in blood that are functionally similar to signatures in brain. These are proposed as candidate biomarkers to be used as a monitoring tool for the state of the disease in brain, but also as a means to determine whether a treatment is successful or not. Show less
Dit proefschrift beschrijft orgaan schade tijdens coronaire bypass operaties (coronary artery bypass surgery; CABG). Orgaan schade wordt deels veroorzaakt door de operatie technieken en kan in... Show moreDit proefschrift beschrijft orgaan schade tijdens coronaire bypass operaties (coronary artery bypass surgery; CABG). Orgaan schade wordt deels veroorzaakt door de operatie technieken en kan in belangrijke mate de klinische resultaten be_nvloeden. Met name voor de oudere comorbide pati_nt kan orgaan schade invloed hebben op het herstel proces en het uiteindelijke resultaat. Middels geselecteerde biomarker bepalingen in bloed en urine (retrospectieve -en prospectief gerandomiseerde studies) , beschrijft dit proefschrift globale -en orgaan specifieke schade tijdens drie verschillende operatie technieken, te weten; Mini-closed Circuit CABG (MCABG), off-pump CABG, een techniek zonder gebruik making van een hartlong machine (OPCAB) en de zogenaamde conventionele on-pump CABG (CCABG). OPCAB en MCABG zijn twee betrekkelijk nieuwe en innovatie technieken. De uitkomsten van de in dit proefschrift verzamelde studies geven aan dat deze twee technieken met minder orgaan schade gepaard gaan. In de discussie van dit proefschrift worden de verkregen resultaten besproken en gerelateerd aan uitkomsten van recent verschenen grote outcome studies betreffende de behandeling van coronaria lijden. Een voorstel wordt geformuleerd hoe deze laatste inzichten op een nuttige wijze in praktijk gebracht kunnen worden. Naar aanleiding van de bestudeerde orgaan schade tijdens de genoemde behandel strategie_n in dit proefschrift lijkt het alsof vocht beperkende strategie_n zoals tijdens MCABG een gunstig effect hebben op peri-operatieve orgaan schade en klinische uitkomsten. Toekomstige studies kunnen dit fenomeen verder verduidelijken. Show less
