Microsatellite and G-quadruplex instability in worm, fish and man

Koole, W. (2015)

Doctoral Thesis

Dit proefschrift beschrijft het onderzoek naar de stabiliteit van twee typen DNA volgordes (sequenties) die vaak voorkomen in DNA: microsatellieten en G-quadruplex sequenties. Microsatellieten zijn kleine stukjes repeterend DNA en G-quadruplex sequenties hebben de unieke eigenschap om een DNA-structuur te vormen die bestaat uit vier DNA-strengen. Bij een celdeling, waarbij het DNA gekopieerd moet worden, blijken deze twee sequenties soms lastig te kopi_ren te zijn. Dit kan tot DNA-instabiliteit leiden. Deze instabiliteit wordt in verband gebracht met kanker en neurodegeneratieve ziektes zoals ALS. Het is daarom van groot belang om alles te weten te komen over microsatelliet- en G-quadruplex-instabiliteit. Allereerst worden in dit proefschrift nieuwe methodes beschreven waarmee de instabiliteit van microsatellieten en G-quadruplexes makkelijk kan worden waargenomen. Met behulp van deze methodes zijn vervolgens verschillende ontdekkingen gedaan. Zo is bijvoorbeeld ontdekt dat in menselijke cellen een klein RNA-molecuul betrokken is bij het instabiel worden van microsatellieten en het ontstaan van darmkanker. Een ander belangrijke bevinding is de ontdekking van een nieuw soort DNA-reparatie mechanisme in de rondworm. De ontdekking van dit mechanisme, waarbij het eiwit polymerase theta G-quadruplex-ge_nduceerde DNA schade repareert, heeft tot nieuwe inzichten geleid op het gebied van genetische mutaties, evolutie en het bestrijden van tumoren.

• Danio rerio
• C. elegans
• Polymerase theta
• Genomic instability
• G-quadruplex
• Microsatellite,

• All authors: Koole, W.
• Supervisor: Tijsterman, M.
• Qualification: Doctor (dr.)
• Awarding Institution: Department of Human Genetics, Faculty of Medicine (LUMC), Leiden University
• Date: 2015-05-13
• ISBN (print): 9789461825544