Regulatory DNA binding peptides as novel tools for plant functional genomics

Lindhout, B.I. (2008)

Doctoral Thesis

Het onderzoek beschreven in het proefschrift van B.I. Lindhout heeft zich gericht op het maken van kunstmatige eiwitten die expressie van genen be_nvloeden, zogeheten zinkvinger bevattende artifici_le transcriptiefactoren. Met dit type eiwitten kan worden onderzocht hoe bepaalde processen in een organisme gereguleerd worden, maar ook om op een nieuwe manier eigenschappen van een organisme te veranderen. Een speciaal type DNA-bindende zinkvingers vormt een onderdeel van deze eiwitten. Het proefschrift beschrijft experimenten die zijn gericht op de verdere uitwerking van deze techniek, vooral voor het plantenbiologisch onderzoek. Er wordt aangetoond dat zinkvinger transcriptiefactoren inderdaad goed gebruikt kunnen worden om een specifiek gen te reguleren, maar ook hoe een grote verzameling daarvan gebruikt kan worden om te zoeken naar verborgen genetische eigenschappen. Deze speciale toepassing houdt in dat specifieke kenmerken die een plant in principe van zichzelf zou kunnen hebben, maar die ontbreken omdat het eigen genetische materiaal van de plant onvoldoende tot uitdrukking komt, plotseling zichtbaar kunnen worden. Zo is gebleken dat introductie van een bepaalde transcriptiefactor de plant in staat stelt zijn DNA veel nauwkeuriger te repareren. Eveneens is beschreven hoe lichtgevende zinkvingers gebruikt kunnen worden om __live__ naar het genetische materiaal van planten- en muizencellen te kunnen kijken.

• Arabidopsis
• Artificial transcription factor
• Genome interrogation
• Mutagenesis
• Zinc finger

• All authors: Lindhout, B.I.
• Supervisor: Hooykaas, P.J.J.
• Co-supervisor: Zaal, E.J. van der
• Qualification: Doctor (dr.)
• Awarding Institution: Faculty of Science, Leiden University
• Date: 2008-10-01